Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSEN1P49768 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSEN1P49768 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms