Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NESP48681 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
NESP48681 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NESP48681 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NESP48681 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NESP48681 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NESP48681 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NESP48681 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NESP48681 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NESP48681 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NESP48681 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NESP48681 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NESP48681 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NESP48681 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NESP48681 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NESP48681 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NESP48681 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NESP48681 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NESP48681 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NESP48681 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NESP48681 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NESP48681 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NESP48681 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NESP48681 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms