Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRIP1P48552 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRIP1P48552 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRIP1P48552 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRIP1P48552 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRIP1P48552 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms