Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSSP48449 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSSP48449 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSSP48449 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSSP48449 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSSP48449 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSSP48449 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSSP48449 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSSP48449 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LSSP48449 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms