Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTRNP46939 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UTRNP46939 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTRNP46939 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UTRNP46939 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UTRNP46939 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTRNP46939 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTRNP46939 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UTRNP46939 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UTRNP46939 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UTRNP46939 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms