Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms