Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP2P42575 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP2P42575 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP2P42575 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP2P42575 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP2P42575 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms