Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC5P40937 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC5P40937 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC5P40937 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC5P40937 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC5P40937 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC5P40937 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC5P40937 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFC5P40937 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms