Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP8P40818 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP8P40818 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP8P40818 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP8P40818 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP8P40818 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP8P40818 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP8P40818 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP8P40818 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP8P40818 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms