Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms