Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 YPS6YIR039C 1614 nt4.94□□□□□ -1.62
CSE4P36012 SRP72YPL210C 1923 nt4.94□□□□□ -1.62
CSE4P36012 GPI8YDR331W 1236 nt4.94□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YLR428CYLR428C 345 nt4.94□□□□□ -1.62
CSE4P36012 GAL4YPL248C 2646 nt4.94□□□□□ -1.62
CSE4P36012 MDM30YLR368W 1797 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YEL1YBL060W 2064 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 PFK1YGR240C 2964 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 SRP68YPL243W 1800 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 LSM8YJR022W 330 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 JEN1YKL217W 1851 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 INN1YNL152W 1230 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 IDH2YOR136W 1110 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 VPS73YGL104C 1461 nt4.93□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YJL015CYJL015C 285 nt4.92□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt4.92□□□□□ -1.62
CSE4P36012 GTT2YLL060C 702 nt4.92□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 RRT13YER066W 558 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YJL202CYJL202C 348 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YNL198CYNL198C 303 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 HSP10YOR020C 321 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 DGK1YOR311C 873 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 YBR259WYBR259W 2067 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 TGL4YKR089C 2733 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 GAC1YOR178C 2382 nt4.91□□□□□ -1.62
CSE4P36012 RAD4YER162C 2265 nt4.9□□□□□ -1.62
CSE4P36012 GIP4YAL031C 2283 nt4.9□□□□□ -1.62
CSE4P36012 FCF2YLR051C 654 nt4.9□□□□□ -1.63
CSE4P36012 FRE4YNR060W 2160 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 VIP1YLR410W 3441 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 MSH4YFL003C 2637 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 NCR1YPL006W 3513 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 ATP17YDR377W 306 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YER091C-AYER091C-A 222 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PAU13YHL046C 363 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YIL012WYIL012W 342 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PET191YJR034W 327 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt4.89□□□□□ -1.63
CSE4P36012 KRI1YNL308C 1776 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 LCB4YOR171C 1875 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YJR030CYJR030C 2238 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 RMT2YDR465C 1239 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YGR265WYGR265W 411 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 SSN8YNL025C 972 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YPL039WYPL039W 951 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PEX5YDR244W 1839 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 RAD54YGL163C 2697 nt4.88□□□□□ -1.63
CSE4P36012 NOG1YPL093W 1944 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YDR193WYDR193W 399 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 FMP32YFL046W 624 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 MSL1YIR009W 336 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 RPS7BYNL096C 573 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PFY1YOR122C 381 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 LYS9YNR050C 1341 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 MSC7YHR039C 1935 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 NAT1YDL040C 2565 nt4.87□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YDR061WYDR061W 1620 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 ACE2YLR131C 2313 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 NHX1YDR456W 1902 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 CYC7YEL039C 342 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 CAJ1YER048C 1176 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YPL142CYPL142C 318 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YPR099CYPR099C 357 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PSE1YMR308C 3270 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 ARG5,6YER069W 2592 nt4.86□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PBS2YJL128C 2007 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YER076W-AYER076W-A 348 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YPL080CYPL080C 327 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PDR5YOR153W 4536 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YDL180WYDL180W 1644 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 SPC72YAL047C 1869 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 EMP70YLR083C 2004 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YCF1YDR135C 4548 nt4.85□□□□□ -1.63
CSE4P36012 PCA1YBR295W 3651 nt4.84□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YKL222CYKL222C 2118 nt4.84□□□□□ -1.63
CSE4P36012 SSP1YHR184W 1716 nt4.84□□□□□ -1.63
CSE4P36012 ARF1YDL192W 546 nt4.84□□□□□ -1.63
CSE4P36012 RPS26BYER131W 360 nt4.84□□□□□ -1.63
CSE4P36012 YIR040CYIR040C 333 nt4.84□□□□□ -1.63
CSE4P36012 ISM1YPL040C 3009 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 snR80snR80 171 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 YFL063WYFL063W 456 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 ISA1YLL027W 753 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 HCH1YNL281W 462 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 YPL238CYPL238C 390 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 OM14YBR230C 405 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 SLM6YBR266C 453 nt4.83□□□□□ -1.64
CSE4P36012 IMH1YLR309C 2736 nt4.82□□□□□ -1.64
CSE4P36012 MTC4YBR255W 2085 nt4.82□□□□□ -1.64
CSE4P36012 ATG21YPL100W 1491 nt4.82□□□□□ -1.64
CSE4P36012 VPS53YJL029C 2469 nt4.82□□□□□ -1.64
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