Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms