Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD13P35453 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms