Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms