Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA4P35212 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA4P35212 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA4P35212 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA4P35212 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA4P35212 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA4P35212 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms