Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-FP30511 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms