Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTGFP29279 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTGFP29279 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTGFP29279 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTGFP29279 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTGFP29279 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTGFP29279 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTGFP29279 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms