Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD34P28906 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD34P28906 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD34P28906 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD34P28906 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD34P28906 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms