Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms