Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK3P27448 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK3P27448 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK3P27448 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK3P27448 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK3P27448 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK3P27448 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK3P27448 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK3P27448 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK3P27448 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK3P27448 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK3P27448 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms