Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFKBIAP25963 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFKBIAP25963 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms