Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms