Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALB2P22676 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALB2P22676 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALB2P22676 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALB2P22676 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALB2P22676 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALB2P22676 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALB2P22676 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALB2P22676 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALB2P22676 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALB2P22676 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALB2P22676 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALB2P22676 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALB2P22676 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALB2P22676 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms