Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms