Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VEGFAP15692 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms