Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRF1P14222 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRF1P14222 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRF1P14222 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms