Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL6A2P12110 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL6A2P12110 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms