Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOP2AP11388 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2AP11388 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms