Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHGAP10645 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHGAP10645 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHGAP10645 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHGAP10645 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHGAP10645 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHGAP10645 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms