Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAVP06756 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms