Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYBBP04839 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYBBP04839 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYBBP04839 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYBBP04839 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYBBP04839 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYBBP04839 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYBBP04839 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYBBP04839 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYBBP04839 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms