Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGAP02671 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGAP02671 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGAP02671 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGAP02671 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGAP02671 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGAP02671 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGAP02671 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGAP02671 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms