Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A1P02462 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A1P02462 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms