Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-5P01602 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms