Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EGFRP00533 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EGFRP00533 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EGFRP00533 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EGFRP00533 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EGFRP00533 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms