Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPLO60437 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPLO60437 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPLO60437 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPLO60437 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPLO60437 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPLO60437 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPLO60437 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPLO60437 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPLO60437 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPLO60437 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPLO60437 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPLO60437 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPLO60437 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPLO60437 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPLO60437 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPLO60437 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPLO60437 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPLO60437 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPLO60437 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms