Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA5O60264 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA5O60264 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms