Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms