Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP9BO43861 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP9BO43861 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP9BO43861 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP9BO43861 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP9BO43861 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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