Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms