Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTPBP6O43824 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms