Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM6AO15550 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM6AO15550 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms