Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLOCKO15516 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms