Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms