Protein–RNA interactions for Protein: O15374

SLC16A4, Monocarboxylate transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A4O15374 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A4O15374 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A4O15374 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A4O15374 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A4O15374 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC16A4O15374 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC16A4O15374 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms