Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN3O14994 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN3O14994 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN3O14994 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN3O14994 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYN3O14994 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYN3O14994 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN3O14994 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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