Protein–RNA interactions for Protein: O00570

SOX1, Transcription factor SOX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX1O00570 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX1O00570 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX1O00570 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOX1O00570 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX1O00570 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX1O00570 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX1O00570 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX1O00570 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms