Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GFRA2O00451 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GFRA2O00451 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms