Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
O00370 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
O00370 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
O00370 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
O00370 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
O00370 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22■■□□□ 1.11
O00370 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
O00370 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
O00370 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms