Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCER2I3L3R5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCER2I3L3R5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCER2I3L3R5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms